Пещера Циклопа раскрыла греческим исследователям тайны, возраст которых исчисляется десятками тысяч лет. Керамика и орудия из камня, кости доисторических животных и украшения, сделанные из морских раковин - все найденное в пещере относится к самым различным историческим периодам – от доисторического до Византийского.
Основные работы проводились археологами в первом зале пещеры Циклопа, расположенном недалеко от входа – он был достаточно густо заселен в свое время и поэтому богат на «следы» доисторической жизни. Более глубокое исследование территории пещеры дало в качестве находок образцы Эллинистической, Классической и Римской эпох. Ученые говорят, что самый значительный след в пещере Циклопа оставила именно Римская эпоха: судя по найденным предметам – в основном это различного вида лампы – в те времена (1-2 века нашей эры) пещера была местом поклонения богам.